Microsoft 365 管理センターへ独自ドメインを追加する際、ドメインの所有権確認行うと、「***.co.jp を所有していることを確認しましたが、現時点ではそのドメインをこのテナントに追加できません。」と表示される

独自ドメインの登録を希望している "***.onmicrosoft.com" 形式の組織ドメインを持つテナントとは別に、独自ドメインを登録済みの別のテナントが発行済みである可能性があります。

独自ドメインは、同一ドメインを複数のテナントへ追加することはできません。。
そのため、発行済みのテナントから該当の独自ドメイン登録を削除することで、任意のテナントに独自ドメインを登録することが可能です。

<参考情報>
#ドメインを削除する

#ドメイン FAQ